根据你的题意，这个小规模纳税人应该是独资企业或者公司，按你的意思要正规做账，只有通过纳税筹划来实现。分述如下：
一、调整经营模式
将没有成本发票的业务核算出来，到底需要量是多大，即采购金额是多少，在工商局重新成立一个个体工商户，将没有成本发票的这部分业务全部移交到个体工商户采购，然后再销售给你的企业，让个体工商户给你的企业开发票。一是新成立的个体工商户解决了上游企业缺成本发票的问题；二是个体工商户由于是核定征收，虽能采购的货物或服务没有发票，只要有资金流、货物流、合同流和对方给开的收款收据，在个体工商户是可以入账进成本的；三是双方都是小规模纳税人，增值税都是简易征收，不存在需要13%的增值税专用发票问题。
二、账务处理
对于你问题中所述成本部分没发票的小规模纳税人企业由于已经通过成立个体工商户解决了发票问题，按正常做账就可以啦。要注意的就是这个企业和新成立的个体工商户之间一定要是真实的交易，即一定要有合同流、货物流和资金流，个体工商户也要记账，只是由于核定征收，不一定全部有发票才能入账，没有发票只要有合规收据和三流也可以入账。另外，个体工商户由于是核定征收，每年初是不用对上年的经营所得进行汇算清缴的。
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